У нас вот так получилось:
В середине октября была в ЛК налоговой заполнена и отправлена первая декларация за 2023 год для вычета по лечению, все доходы - от вкладов, и расписаны по каждому банку отдельно. Её проверили за два (!) дня, ну и разумеется весь начисленный налог выставился к повторной оплате, а также заодно насчитали пени за типа год просрочки платежа. Посмотрев на этот мрак, отправили в ЛК обращение с просьбой пересчитать. До конца месяца никакой реакции так и не последовало, так что попробовали позвонить в налоговую сами: нашли на сайте инспекции добавочный номер, помеченный как "Вопросы расчетов по форме 3-НДФЛ", объяснили там своими словами ситуацию - мол, налог в полном объеме оплачен год назад, а его по проверенной декларации требуют платить заново и пенями пугают, как так-то. Прямо в ходе разговора инспектор нам сообщил, что всё поправил, а через несколько дней задвоение вместе с пенями из ЛК пропало, искомый вычет добавился на ЕНС как переплата.
Видимо, у меня в районе какая-то нетипичная ИФНС.