По облигациям при первой выплате купона (после покупки) сумма НКД учитывается как расход. В налоговом отчёте этой информации нет. Тоже долго не мог понять, откуда получаются суммы.
Таким образом, в год первой выплаты купона, налоговая база будет меньше на уплаченный НКД, а в год продажи...