Да, по СБП (не только по QR - коду) можно переводить более 1,0 млн. рублей за один раз, единственное, некоторые банки устанавливают лимит на перевод - к примеру, Реалист не более 600,0 тыс. рублей за перевод.
Необходимая сумма сразу обозначается при попытке перевода.