Нет, не за вычетом. Учитываются все налогооблагаемые доходы, но до удержания налога.
Полагаю, что в целом можно прикидывать доходы, исходя из начисленного за год налога (в т.ч. и по ИИС, например, по дивидендам). Но личного опыта нет, могу ошибиться.
@Ekaterina, правильно.